儀器校驗審核的路線和方法自上而下和自下而上的方法;正向和逆向的審核方法;按要素審核和按部門審核的方法;例行審核的路線和方法，應在制訂計劃時予以確定，審核員編制檢查表時，也應按計劃中確定的方法;但特殊情況下的專項審核，可按當時情況臨時決定。審核的目的尋找符合或不符合標準、規范或有關程序的客觀依據。

不合格項確定后要填寫不合格工作登記表及糾正措施要求表受控文件請妥善保管第版主題內部質量審核第頁第次修訂共頁頒布日期年月日編號可能出現三個類型的不合格體系性不合格;實施性不合格;效果性不合格;還有一類問題雖末構成不合格，但有發展成不合格的趨勢，應作為觀察項口頭向受審核方提出，引起注意。但審核組應保留一份口頭提出的觀察項的記錄。審核組在質量保部門的指導下編寫糾正措施要求表審核結果的匯總分析內容包括從發現的不合格項來匯總分析部門或要素的薄弱環節。

從發展的歷史和趨勢分析，與上次內審情況比較，總結質量管理進步情況。儀器校驗從各次審核結果之間比較，該部門領導對質量管理工作的重視程度。總結質量工作優缺點。這些匯總分析的基礎上，可做出該部門或該要素在整個質量體系的質量活動中是好的基本上是好的或問題較多、有待切實改進等結論性意見。這些匯總分析的意見應及時 與受審核部門領導溝通，征求意見，取得共識。